NGO的财务管理是指如何合理有效地利用组织的财力和物力资源，以保证组织的活动能够顺利开展。NGO的资产来自于各种各样的捐赠和资助，所以组织能否高效合理的利用这些资产、能否公开、透明组织的财务管理状况、能否接受社会公众的监督就成了非营利组织是否具有诚信的根本。
　　财务战略管理是指一个组织运作的综合管理体系，它将合理有效的匹配组织的内部资源和外部机会与风险，从而使组织得以持续发展。NGO提供的服务是享受资助和政府免税的，因此组织的经营活动必须服从或服务于公众利益，从这个意义上讲，组织所承受的政治压力远大于市场压力，财务的社会责任也较大。因此，非常有必要建立与组织发展战略相互动的财务管理战略, 以全面指导财务管理工作。
　　一个成熟的NGO必须遵从财务方面的基本原则。建立财务管理战略，如何编制预算，使其能够准确地反映出组织各项工作的直接成本（项目费用）和间接成本（行政费用）并准确地预测出未来的资金需求；建立现金管理政策降低现金丢失和管理不当的财务风险；建立明确的审计制度，使财务管理更加透明化以获得捐助者的信任。

从会计体系来看，过去我国民间组织会计属于事业单位会计，作为预算会计的一个分支，遵照执行《事业单位财务规则》、《事业单位会计准则》和《事业单位会计制度》。自2005年1月1日起，财政部颁布的《民间非营利组织会计制度》开始在社会团体、基金会、民办非企业单位和寺院、宫观、清真寺、教堂等民间非营利组织内实施。这为我们与国际惯例接轨，根据NGO财务的特点将其作为一个单独的领域设计财务控制规则并实施财务控制奠定了良好的制度基础。按照公认会计准则(GAAP)，严格非营利组织的财务报表、财务分析、财务预算、成本控制。特别是加强非营利组织捐赠收入和捐赠支出的会计处理，加强转让资产给非营利组织，募捐或接受捐赠的公益信托。通过预算控制、制度控制、收入控制和支出控制等主要手段规范财务收支行为，严格监控组织财务会计的状况。

加强NGO的财务状况的外部审计，提高外部监督力度。除了NGO内部提供的财务报告外，由审计部门或独立注册会计师给出的财务审计报告应该按时的予以公布，这对于完善组织内部财务制度，提高组织的公信度有着巨大的作用。之所以要进行外部审计是由于；一、法律的规定，作为我国民间组织的主管部门民政部要求每年对组织审查一次，其中主要是财务审计；二、NGO特定的基金来源性质所定；三、可以使组织财务更值得信赖，向捐赠者保证捐款的使用管理情况良好的需要。

作为外部审计人员的财务审计必须完成的事项应当有：①审核财务报表；②对财务报表的缺失提供建议；⑧根据一般公认会计原则的规定，提供员工技术性赞助；④审核工时表及请假卡等纪录；⑤分析设置各个基金账户：⑥分析组织投资政策及手续相关规定；(7)审核筹资基金纪录。

起步阶段的NGO往往没有专职的财务人员，但是作为一个组织，财务管理仍然是非常重要的问题。选择有良好公信的较成熟的NGO托管财务是一个比较好的过渡时期解决办法。